Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
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Ggta1P23336 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
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Ggta1P23336 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
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Ggta1P23336 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Ggta1P23336 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Ggta1P23336 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Ggta1P23336 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Ggta1P23336 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Ggta1P23336 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Ggta1P23336 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Ggta1P23336 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms