Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
RarbP22605 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
RarbP22605 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
RarbP22605 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
RarbP22605 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
RarbP22605 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
RarbP22605 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
RarbP22605 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
RarbP22605 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
RarbP22605 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
RarbP22605 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
RarbP22605 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
RarbP22605 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RarbP22605 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RarbP22605 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RarbP22605 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RarbP22605 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RarbP22605 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RarbP22605 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RarbP22605 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RarbP22605 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RarbP22605 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RarbP22605 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RarbP22605 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RarbP22605 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RarbP22605 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RarbP22605 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RarbP22605 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RarbP22605 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RarbP22605 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RarbP22605 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RarbP22605 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RarbP22605 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RarbP22605 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RarbP22605 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
RarbP22605 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
RarbP22605 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RarbP22605 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
RarbP22605 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RarbP22605 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RarbP22605 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
RarbP22605 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
RarbP22605 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RarbP22605 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RarbP22605 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RarbP22605 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RarbP22605 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RarbP22605 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RarbP22605 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RarbP22605 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RarbP22605 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RarbP22605 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RarbP22605 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RarbP22605 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RarbP22605 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RarbP22605 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RarbP22605 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RarbP22605 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RarbP22605 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RarbP22605 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RarbP22605 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RarbP22605 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RarbP22605 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RarbP22605 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RarbP22605 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RarbP22605 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RarbP22605 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RarbP22605 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RarbP22605 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RarbP22605 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RarbP22605 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RarbP22605 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RarbP22605 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RarbP22605 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RarbP22605 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RarbP22605 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RarbP22605 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
RarbP22605 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RarbP22605 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RarbP22605 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
RarbP22605 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
RarbP22605 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RarbP22605 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RarbP22605 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RarbP22605 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RarbP22605 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RarbP22605 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RarbP22605 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
RarbP22605 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RarbP22605 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RarbP22605 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RarbP22605 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RarbP22605 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RarbP22605 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RarbP22605 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RarbP22605 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
RarbP22605 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RarbP22605 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RarbP22605 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RarbP22605 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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