Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms