Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P20040 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
P20040 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P20040 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
P20040 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P20040 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P20040 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P20040 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P20040 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P20040 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P20040 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P20040 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P20040 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P20040 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P20040 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P20040 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P20040 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P20040 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P20040 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P20040 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P20040 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P20040 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P20040 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P20040 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P20040 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P20040 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P20040 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P20040 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P20040 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P20040 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P20040 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P20040 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P20040 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P20040 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P20040 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P20040 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P20040 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P20040 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P20040 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P20040 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P20040 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P20040 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P20040 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P20040 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P20040 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P20040 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P20040 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P20040 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P20040 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P20040 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P20040 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P20040 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P20040 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P20040 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P20040 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P20040 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P20040 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P20040 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P20040 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P20040 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P20040 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P20040 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P20040 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P20040 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P20040 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P20040 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P20040 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P20040 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P20040 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P20040 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P20040 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P20040 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P20040 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P20040 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P20040 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P20040 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P20040 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P20040 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P20040 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P20040 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P20040 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P20040 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P20040 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P20040 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P20040 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P20040 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P20040 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P20040 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P20040 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P20040 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P20040 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P20040 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P20040 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P20040 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P20040 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P20040 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P20040 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P20040 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P20040 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P20040 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms