Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18524 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P18524 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18524 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18524 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18524 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P18524 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P18524 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P18524 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18524 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18524 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18524 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18524 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18524 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P18524 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P18524 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18524 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18524 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18524 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18524 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18524 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18524 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18524 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18524 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18524 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18524 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18524 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18524 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P18524 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P18524 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
P18524 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P18524 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P18524 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P18524 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18524 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18524 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18524 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18524 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P18524 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18524 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18524 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18524 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18524 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18524 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18524 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18524 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P18524 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18524 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18524 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P18524 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P18524 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P18524 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P18524 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P18524 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P18524 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P18524 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P18524 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18524 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18524 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18524 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18524 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P18524 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18524 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18524 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P18524 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P18524 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P18524 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P18524 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P18524 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18524 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18524 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18524 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18524 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18524 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18524 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18524 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18524 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18524 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18524 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18524 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18524 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18524 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18524 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18524 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18524 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18524 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18524 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18524 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18524 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18524 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18524 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P18524 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18524 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18524 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18524 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18524 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P18524 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18524 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18524 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18524 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms