Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Acrbp-201ENSMUST00000032481 584 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Tas2r121-201ENSMUST00000095395 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm21115-201ENSMUST00000187565 2578 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Txk-201ENSMUST00000113604 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Duxbl1-201ENSMUST00000049793 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Rapgef4os2-201ENSMUST00000128165 2116 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Fam71e2-202ENSMUST00000174409 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Olfr1171-ps1-202ENSMUST00000150178 1398 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Ntrk3-206ENSMUST00000195262 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
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Hoxb1P17919 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm15940-201ENSMUST00000156011 817 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Olfr1315-ps1-201ENSMUST00000207542 1230 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 AC113082.2-201ENSMUST00000215876 756 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Sqor-202ENSMUST00000110506 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Acox2-204ENSMUST00000164598 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Tmem30c-203ENSMUST00000120112 3478 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Slc14a2-201ENSMUST00000025434 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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