Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PcnaP17918 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcnaP17918 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcnaP17918 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcnaP17918 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcnaP17918 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PcnaP17918 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcnaP17918 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcnaP17918 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcnaP17918 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcnaP17918 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcnaP17918 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcnaP17918 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PcnaP17918 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcnaP17918 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PcnaP17918 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcnaP17918 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcnaP17918 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PcnaP17918 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms