Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Rnf123-207ENSMUST00000160249 4426 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Ncbp3-201ENSMUST00000021135 12106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Atp2b2-202ENSMUST00000101044 4586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Ncapd3-202ENSMUST00000086198 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Celf1-203ENSMUST00000068747 7614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Cacna1c-214ENSMUST00000188106 6462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Nek4-203ENSMUST00000226551 4098 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Myo18a-203ENSMUST00000092887 7304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Asxl2-207ENSMUST00000153102 4462 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Cacna1d-204ENSMUST00000223803 6435 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Tktl2-202ENSMUST00000183187 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms