Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 AC133498.1-203ENSMUST00000221213 668 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm15283-202ENSMUST00000221427 818 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 CT025523.1-201ENSMUST00000228318 694 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Tmsb15b2-201ENSMUST00000069803 450 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 2810006K23Rik-201ENSMUST00000077376 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Mup6-201ENSMUST00000107517 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Mup6-202ENSMUST00000107520 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm13339-201ENSMUST00000120651 510 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm15746-201ENSMUST00000120684 1027 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 AA623943-201ENSMUST00000121794 354 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm16210-201ENSMUST00000122161 610 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm4943-201ENSMUST00000132879 424 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm14095-201ENSMUST00000134264 516 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm22038-201ENSMUST00000157277 242 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm37708-201ENSMUST00000192337 895 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm29678-201ENSMUST00000193966 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm40155-201ENSMUST00000198291 818 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm44181-201ENSMUST00000203106 483 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm18690-201ENSMUST00000204488 985 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Wbp1-209ENSMUST00000205023 716 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm45458-201ENSMUST00000209900 522 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Sult2b1-207ENSMUST00000210754 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 CAAA01216754.4-201ENSMUST00000216416 802 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 3830406C13Rik-203ENSMUST00000223631 1014 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Vmn1r28-203ENSMUST00000228678 909 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Tas2r106-201ENSMUST00000076756 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 2900018N21Rik-201ENSMUST00000195805 1580 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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