Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms