Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Kpna3O35344 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms