Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Q1O19441 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Q1O19441 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Q1O19441 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Q1O19441 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Q1O19441 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Q1O19441 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Q1O19441 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Q1O19441 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Q1O19441 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Q1O19441 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Q1O19441 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Q1O19441 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Q1O19441 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Q1O19441 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Q1O19441 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Q1O19441 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Q1O19441 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Q1O19441 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Q1O19441 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Q1O19441 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Q1O19441 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Q1O19441 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Q1O19441 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Q1O19441 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Q1O19441 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Q1O19441 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Q1O19441 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Q1O19441 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Q1O19441 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Q1O19441 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Q1O19441 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Q1O19441 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Q1O19441 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Q1O19441 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Q1O19441 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Q1O19441 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Q1O19441 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Q1O19441 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Q1O19441 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Q1O19441 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Q1O19441 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Q1O19441 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Q1O19441 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Q1O19441 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Q1O19441 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Q1O19441 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Q1O19441 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Q1O19441 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Q1O19441 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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H2-Q1O19441 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Q1O19441 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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H2-Q1O19441 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Q1O19441 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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H2-Q1O19441 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Q1O19441 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Q1O19441 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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H2-Q1O19441 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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H2-Q1O19441 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Q1O19441 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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H2-Q1O19441 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Q1O19441 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Q1O19441 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Q1O19441 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Q1O19441 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Q1O19441 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Q1O19441 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Q1O19441 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Q1O19441 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Q1O19441 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Q1O19441 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Q1O19441 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
H2-Q1O19441 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
H2-Q1O19441 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
H2-Q1O19441 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
H2-Q1O19441 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
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