Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms