Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3P4

Cenpf, Centromere protein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpfE9Q3P4 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CenpfE9Q3P4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CenpfE9Q3P4 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CenpfE9Q3P4 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CenpfE9Q3P4 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CenpfE9Q3P4 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
CenpfE9Q3P4 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CenpfE9Q3P4 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CenpfE9Q3P4 Rfc4-203ENSMUST00000115338 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CenpfE9Q3P4 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CenpfE9Q3P4 Gm16013-201ENSMUST00000152249 353 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CenpfE9Q3P4 Atad3aos-204ENSMUST00000174185 482 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CenpfE9Q3P4 Gm26379-201ENSMUST00000178125 138 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
CenpfE9Q3P4 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CenpfE9Q3P4 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CenpfE9Q3P4 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CenpfE9Q3P4 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CenpfE9Q3P4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CenpfE9Q3P4 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CenpfE9Q3P4 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CenpfE9Q3P4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CenpfE9Q3P4 Lims1-201ENSMUST00000020077 1565 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CenpfE9Q3P4 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CenpfE9Q3P4 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CenpfE9Q3P4 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CenpfE9Q3P4 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CenpfE9Q3P4 Gm13134-201ENSMUST00000132106 738 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CenpfE9Q3P4 Gm12847-201ENSMUST00000156219 413 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CenpfE9Q3P4 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
CenpfE9Q3P4 Gm9409-201ENSMUST00000197017 316 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
CenpfE9Q3P4 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
CenpfE9Q3P4 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CenpfE9Q3P4 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CenpfE9Q3P4 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CenpfE9Q3P4 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CenpfE9Q3P4 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CenpfE9Q3P4 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CenpfE9Q3P4 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CenpfE9Q3P4 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CenpfE9Q3P4 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CenpfE9Q3P4 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CenpfE9Q3P4 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CenpfE9Q3P4 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CenpfE9Q3P4 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CenpfE9Q3P4 Gm6939-201ENSMUST00000122029 864 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
CenpfE9Q3P4 Gm11521-201ENSMUST00000143302 329 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CenpfE9Q3P4 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CenpfE9Q3P4 AC102312.1-202ENSMUST00000218600 851 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CenpfE9Q3P4 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CenpfE9Q3P4 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CenpfE9Q3P4 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CenpfE9Q3P4 4930593A02Rik-201ENSMUST00000181694 1437 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CenpfE9Q3P4 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CenpfE9Q3P4 4933405D12Rik-201ENSMUST00000180557 1383 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
CenpfE9Q3P4 A930003O13Rik-202ENSMUST00000197486 3098 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
CenpfE9Q3P4 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
CenpfE9Q3P4 Gm11497-201ENSMUST00000138295 2154 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
CenpfE9Q3P4 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
CenpfE9Q3P4 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
CenpfE9Q3P4 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
CenpfE9Q3P4 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
CenpfE9Q3P4 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
CenpfE9Q3P4 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
CenpfE9Q3P4 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
CenpfE9Q3P4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpfE9Q3P4 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpfE9Q3P4 Gm14997-201ENSMUST00000119232 636 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpfE9Q3P4 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpfE9Q3P4 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpfE9Q3P4 Stard6-206ENSMUST00000174118 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpfE9Q3P4 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpfE9Q3P4 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpfE9Q3P4 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpfE9Q3P4 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpfE9Q3P4 Scgb1c1-201ENSMUST00000035300 455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpfE9Q3P4 Gm10134-201ENSMUST00000074761 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpfE9Q3P4 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpfE9Q3P4 Gm6378-201ENSMUST00000084199 444 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpfE9Q3P4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpfE9Q3P4 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpfE9Q3P4 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpfE9Q3P4 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpfE9Q3P4 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpfE9Q3P4 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpfE9Q3P4 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpfE9Q3P4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpfE9Q3P4 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpfE9Q3P4 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpfE9Q3P4 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpfE9Q3P4 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpfE9Q3P4 Shf-205ENSMUST00000121237 882 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpfE9Q3P4 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpfE9Q3P4 Eif3k-204ENSMUST00000208616 909 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpfE9Q3P4 Nudc-ps1-201ENSMUST00000209275 551 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpfE9Q3P4 Gm18164-201ENSMUST00000213769 927 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpfE9Q3P4 Gm18166-201ENSMUST00000215557 927 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpfE9Q3P4 CU025215.1-201ENSMUST00000222986 603 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpfE9Q3P4 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpfE9Q3P4 Scgb3a1-201ENSMUST00000043873 493 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpfE9Q3P4 Gm9869-201ENSMUST00000063858 375 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms