Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Olfr805-201ENSMUST00000078876 960 ntAPPRIS P1 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Vmn1r83-201ENSMUST00000086229 996 ntAPPRIS P1 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Olfr1241-201ENSMUST00000099778 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Gm21043-201ENSMUST00000199316 1517 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Gm29537-202ENSMUST00000186153 1498 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 AC121942.3-201ENSMUST00000225768 1436 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Mageb8-ps-201ENSMUST00000117228 1033 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Gm15754-201ENSMUST00000119191 478 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Rpl15-ps4-201ENSMUST00000122372 606 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Gm3594-201ENSMUST00000169152 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Vmn1r-ps49-201ENSMUST00000177009 879 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 BE692007-201ENSMUST00000186054 954 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Gm6140-201ENSMUST00000192494 966 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
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Gm3250E9Q1M3 Gm19065-202ENSMUST00000203910 1165 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Gm44582-201ENSMUST00000209125 445 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Gm34099-201ENSMUST00000211592 704 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 CT025611.2-201ENSMUST00000220475 879 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 AC154838.2-201ENSMUST00000226602 747 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Stfa2-201ENSMUST00000023619 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Tex46-201ENSMUST00000046647 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Gm24623-201ENSMUST00000082616 194 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
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