Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Cacna1d-202ENSMUST00000112250 8688 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Baz2a-203ENSMUST00000217851 8385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Slco5a1-207ENSMUST00000188454 8463 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Zfp827-202ENSMUST00000098614 7581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Clic5-201ENSMUST00000024755 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Nkap-201ENSMUST00000016553 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Trio-210ENSMUST00000227337 6375 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Cxcl12-201ENSMUST00000073043 5627 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Nav2-216ENSMUST00000184945 10665 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Myo1c-202ENSMUST00000102504 4659 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Ap3m1-206ENSMUST00000154460 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Ctnnd1-217ENSMUST00000111691 5380 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Igf2bp1-201ENSMUST00000013559 8378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Zc3hav1-203ENSMUST00000114900 4944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Htr5a-201ENSMUST00000036227 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Nfrkb-201ENSMUST00000086167 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm43274-201ENSMUST00000202545 5000 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Sptbn1-203ENSMUST00000102838 9107 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Kat6b-209ENSMUST00000182964 7699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Ctnnd1-209ENSMUST00000111678 5870 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Pms2-209ENSMUST00000148011 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Myo15-201ENSMUST00000071880 11769 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Cemip-201ENSMUST00000064174 7111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Lrba-204ENSMUST00000194759 9379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 2410089E03Rik-201ENSMUST00000110617 10469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Lama1-201ENSMUST00000035471 9518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Adamtsl1-209ENSMUST00000141889 7805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms