Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms