Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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