Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I4

Robo3, Roundabout homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo3Q9Z2I4 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
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Robo3Q9Z2I4 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Robo3Q9Z2I4 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Robo3Q9Z2I4 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Robo3Q9Z2I4 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Robo3Q9Z2I4 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms