Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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