Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Olfr1335-202ENSMUST00000219094 1148 ntAPPRIS P2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 AC155709.2-201ENSMUST00000219360 678 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Olfr1335-201ENSMUST00000084313 1148 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Gm23439-201ENSMUST00000104292 132 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Gm829-201ENSMUST00000123741 465 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Gm42617-201ENSMUST00000197640 1229 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 AC124613.1-201ENSMUST00000198711 88 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Ccdc130-201ENSMUST00000005120 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Gm14997-201ENSMUST00000119232 636 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Cdk1-202ENSMUST00000119827 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 6430531B16Rik-202ENSMUST00000121412 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Col5a3Q9JLI2 Gm16227-201ENSMUST00000160088 563 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Col5a3Q9JLI2 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Gm8796-201ENSMUST00000219122 936 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 AC122840.4-201ENSMUST00000221310 1285 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 AC107711.4-201ENSMUST00000228948 440 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
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Col5a3Q9JLI2 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Col5a3Q9JLI2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Myc-204ENSMUST00000160009 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Gm13286-201ENSMUST00000117750 537 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Gm12009-201ENSMUST00000121361 1100 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 2210408F21Rik-209ENSMUST00000146778 579 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Gm12676-201ENSMUST00000149078 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Gm8226-201ENSMUST00000190511 798 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms