Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
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Hmgn5Q9JL35 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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