Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN6

Trim2, Tripartite motif-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim2Q9ESN6 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Trim2Q9ESN6 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trim2Q9ESN6 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trim2Q9ESN6 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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