Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Vwf-203ENSMUST00000112254 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 9330175E14Rik-201ENSMUST00000180445 4852 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Gm32742-201ENSMUST00000210433 8516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Clasp1-208ENSMUST00000187713 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Plec-206ENSMUST00000074834 14855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Wdr61Q9ERF3 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms