Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

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Length 313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms