Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Gtf2e1Q9D0D5 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gtf2e1Q9D0D5 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gtf2e1Q9D0D5 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gtf2e1Q9D0D5 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gtf2e1Q9D0D5 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gtf2e1Q9D0D5 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf2e1Q9D0D5 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf2e1Q9D0D5 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf2e1Q9D0D5 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf2e1Q9D0D5 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf2e1Q9D0D5 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf2e1Q9D0D5 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf2e1Q9D0D5 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf2e1Q9D0D5 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf2e1Q9D0D5 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf2e1Q9D0D5 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf2e1Q9D0D5 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf2e1Q9D0D5 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf2e1Q9D0D5 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf2e1Q9D0D5 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf2e1Q9D0D5 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf2e1Q9D0D5 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf2e1Q9D0D5 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf2e1Q9D0D5 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf2e1Q9D0D5 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf2e1Q9D0D5 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf2e1Q9D0D5 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf2e1Q9D0D5 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf2e1Q9D0D5 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf2e1Q9D0D5 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf2e1Q9D0D5 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf2e1Q9D0D5 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf2e1Q9D0D5 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf2e1Q9D0D5 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf2e1Q9D0D5 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf2e1Q9D0D5 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf2e1Q9D0D5 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf2e1Q9D0D5 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf2e1Q9D0D5 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf2e1Q9D0D5 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf2e1Q9D0D5 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf2e1Q9D0D5 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf2e1Q9D0D5 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf2e1Q9D0D5 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf2e1Q9D0D5 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf2e1Q9D0D5 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf2e1Q9D0D5 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf2e1Q9D0D5 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf2e1Q9D0D5 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf2e1Q9D0D5 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms