Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

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Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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