Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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