Protein–RNA interactions for Protein: Q99N10

Ms4a8, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 8, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a8Q99N10 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a8Q99N10 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a8Q99N10 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a8Q99N10 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a8Q99N10 Ctdspl2-203ENSMUST00000110574 1616 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a8Q99N10 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Ms4a8Q99N10 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a8Q99N10 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a8Q99N10 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Ms4a8Q99N10 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a8Q99N10 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Ms4a8Q99N10 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Ms4a8Q99N10 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Ms4a8Q99N10 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ms4a8Q99N10 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ms4a8Q99N10 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Ms4a8Q99N10 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ms4a8Q99N10 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Ms4a8Q99N10 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ms4a8Q99N10 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ms4a8Q99N10 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ms4a8Q99N10 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ms4a8Q99N10 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Ms4a8Q99N10 5330439A09Rik-201ENSMUST00000162770 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Ms4a8Q99N10 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Ms4a8Q99N10 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ms4a8Q99N10 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ms4a8Q99N10 9630028H03Rik-202ENSMUST00000153402 1559 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ms4a8Q99N10 Gm37082-201ENSMUST00000192629 1927 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ms4a8Q99N10 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ms4a8Q99N10 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ms4a8Q99N10 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ms4a8Q99N10 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ms4a8Q99N10 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ms4a8Q99N10 Olfr1428-202ENSMUST00000208391 1368 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Ms4a8Q99N10 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms