Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME3

Sncaip, Synphilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncaipQ99ME3 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SncaipQ99ME3 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms