Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Smim11aQ99J19 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Smim11aQ99J19 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Smim11aQ99J19 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
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Smim11aQ99J19 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
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Smim11aQ99J19 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms