Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms