Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Mid1-201ENSMUST00000036753 3753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Lipg-201ENSMUST00000066532 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Ttc16-206ENSMUST00000161430 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
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Ssh3Q8K330 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Ssh3Q8K330 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Ssh3Q8K330 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Ssh3Q8K330 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Ssh3Q8K330 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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