Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2P6

Rfesd, Rieske domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfesdQ8K2P6 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RfesdQ8K2P6 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms