Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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