Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0S4

Ttc21a, Tetratricopeptide repeat protein 21A, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21aQ8C0S4 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc21aQ8C0S4 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms