Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Mipol1-205ENSMUST00000145003 1424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Lrriq3-202ENSMUST00000192383 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 BC003331-201ENSMUST00000006167 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Gm14932-201ENSMUST00000117112 453 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Gm13775-201ENSMUST00000153865 751 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Gm23116-201ENSMUST00000158481 67 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Gm28489-201ENSMUST00000186655 316 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Gm28490-202ENSMUST00000190946 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Gm44603-201ENSMUST00000206820 367 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Uqcrb-201ENSMUST00000021993 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 AC154738.1-201ENSMUST00000227054 368 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 AC118250.1-201ENSMUST00000228569 875 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Defb1-201ENSMUST00000051017 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Olfr1026-201ENSMUST00000056718 965 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Nat2-202ENSMUST00000163856 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Gm9603-201ENSMUST00000165814 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Gm3542-201ENSMUST00000169362 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Gm11483-201ENSMUST00000119839 247 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Olfr999-ps1-201ENSMUST00000122319 949 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Gm11267-201ENSMUST00000137477 1071 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Gm8022-201ENSMUST00000191763 904 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Gm19219-201ENSMUST00000215863 724 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Gm18292-201ENSMUST00000216673 919 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 AC161245.1-201ENSMUST00000217207 740 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 AC164315.1-202ENSMUST00000226723 657 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 AC129208.2-201ENSMUST00000228506 320 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Tmco5-201ENSMUST00000028834 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms