Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms