Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
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H2-M10.4Q85ZW8 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
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H2-M10.4Q85ZW8 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
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H2-M10.4Q85ZW8 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
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H2-M10.4Q85ZW8 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
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H2-M10.4Q85ZW8 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
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H2-M10.4Q85ZW8 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
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H2-M10.4Q85ZW8 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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