Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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