Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Atg2aQ6P4T0 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms