Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
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PtprdQ64487 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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