Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Tex46-201ENSMUST00000046647 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Ccdc30-203ENSMUST00000084307 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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Ccdc18Q640L5 Fkbp6-202ENSMUST00000201534 1287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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Ccdc18Q640L5 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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Ccdc18Q640L5 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 B430203G13Rik-201ENSMUST00000169657 1375 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
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Ccdc18Q640L5 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
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Ccdc18Q640L5 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Zfp655-204ENSMUST00000199003 601 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
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Ccdc18Q640L5 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Gm10228-201ENSMUST00000089105 532 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
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Ccdc18Q640L5 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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Ccdc18Q640L5 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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Ccdc18Q640L5 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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Ccdc18Q640L5 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Gm20568-201ENSMUST00000197129 208 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Olfr1335-202ENSMUST00000219094 1148 ntAPPRIS P2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 CT030035.1-201ENSMUST00000223964 935 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Olfr1335-201ENSMUST00000084313 1148 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Cd300ld3-201ENSMUST00000092459 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Gm8873-201ENSMUST00000217847 1439 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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