Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim28Q62318 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms