Protein–RNA interactions for Protein: Q62059

Vcan, Versican core protein, mousemouse

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Length 3,357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcanQ62059 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VcanQ62059 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VcanQ62059 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VcanQ62059 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VcanQ62059 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VcanQ62059 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VcanQ62059 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VcanQ62059 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VcanQ62059 AC107711.3-201ENSMUST00000228939 1035 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
VcanQ62059 Olfr642-201ENSMUST00000052660 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VcanQ62059 Gm5424-201ENSMUST00000053865 1240 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
VcanQ62059 Olfr1511-201ENSMUST00000078171 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VcanQ62059 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VcanQ62059 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VcanQ62059 Gpr75-201ENSMUST00000109430 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VcanQ62059 Exosc9-201ENSMUST00000029269 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VcanQ62059 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VcanQ62059 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VcanQ62059 Ccl6-201ENSMUST00000019071 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VcanQ62059 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VcanQ62059 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VcanQ62059 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VcanQ62059 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VcanQ62059 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VcanQ62059 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VcanQ62059 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VcanQ62059 Pabpn1-203ENSMUST00000139985 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VcanQ62059 Gm8174-201ENSMUST00000064353 1001 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
VcanQ62059 5330411J11Rik-201ENSMUST00000137162 1635 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VcanQ62059 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VcanQ62059 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VcanQ62059 Plekha7-206ENSMUST00000182487 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VcanQ62059 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VcanQ62059 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VcanQ62059 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VcanQ62059 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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VcanQ62059 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VcanQ62059 Cxcr1-201ENSMUST00000053389 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VcanQ62059 Mrgpra1-201ENSMUST00000098438 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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VcanQ62059 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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VcanQ62059 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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VcanQ62059 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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VcanQ62059 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VcanQ62059 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VcanQ62059 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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VcanQ62059 Pbdc1-202ENSMUST00000119477 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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VcanQ62059 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
VcanQ62059 Gm45591-201ENSMUST00000129058 843 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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VcanQ62059 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VcanQ62059 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VcanQ62059 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VcanQ62059 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VcanQ62059 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VcanQ62059 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VcanQ62059 2210408F21Rik-209ENSMUST00000146778 579 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VcanQ62059 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VcanQ62059 Eif3k-201ENSMUST00000066070 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VcanQ62059 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VcanQ62059 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VcanQ62059 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VcanQ62059 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
VcanQ62059 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VcanQ62059 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VcanQ62059 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VcanQ62059 Elf2-213ENSMUST00000195432 2161 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VcanQ62059 Gm13688-201ENSMUST00000121557 608 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
VcanQ62059 Gm12811-201ENSMUST00000125237 667 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VcanQ62059 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VcanQ62059 Gm15419-201ENSMUST00000148654 743 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VcanQ62059 Ighv6-4-201ENSMUST00000177949 297 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VcanQ62059 Cks2-201ENSMUST00000075853 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VcanQ62059 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VcanQ62059 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VcanQ62059 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VcanQ62059 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VcanQ62059 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VcanQ62059 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VcanQ62059 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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