Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Oprm1-213ENSMUST00000105604 1616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Gm13134-201ENSMUST00000132106 738 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Gm27826-201ENSMUST00000175282 255 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Mir124-2hg-203ENSMUST00000186923 673 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Gm8226-201ENSMUST00000190511 798 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 AC154477.1-201ENSMUST00000226515 773 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 AC137842.2-201ENSMUST00000227734 797 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 2700038G22Rik-201ENSMUST00000181574 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Gm26174-201ENSMUST00000158415 219 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Gm26610-201ENSMUST00000181529 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Gm37207-201ENSMUST00000194284 296 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 AC156790.2-201ENSMUST00000227115 568 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Gm13456-201ENSMUST00000118928 1365 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Gm23129-201ENSMUST00000104259 132 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 2410124H12Rik-201ENSMUST00000160494 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Gm20483-201ENSMUST00000173162 851 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Olfr209-202ENSMUST00000208246 428 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Defb12-201ENSMUST00000062113 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Atp6v1c2-202ENSMUST00000095820 1549 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Nup188-202ENSMUST00000113634 534 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Zcwpw2-203ENSMUST00000187803 372 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 AC154347.2-201ENSMUST00000221223 715 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Fibp-205ENSMUST00000225141 1209 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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