Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Olfr1335-201ENSMUST00000084313 1148 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Gm10581-201ENSMUST00000097986 231 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Cyp2a21-ps-201ENSMUST00000206638 1471 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Wfdc3-202ENSMUST00000109328 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Cryzl1-206ENSMUST00000124282 1187 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Gm22388-201ENSMUST00000158194 248 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Gm27444-201ENSMUST00000184157 137 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 AC117769.1-201ENSMUST00000224716 1120 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Gm12028-201ENSMUST00000118065 436 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 4930573C15Rik-201ENSMUST00000197707 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Gm9644-201ENSMUST00000212828 1183 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Defb29-201ENSMUST00000060598 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Sectm1b-202ENSMUST00000081499 1222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Plut-202ENSMUST00000174285 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms