Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.5 ms