Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Xlr5a-203ENSMUST00000114521 1474 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm15819-201ENSMUST00000153089 481 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm21542-201ENSMUST00000182307 993 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm5307-201ENSMUST00000204772 760 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 AC110816.1-201ENSMUST00000218559 980 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 AC192334.1-201ENSMUST00000221832 1268 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm36862-204ENSMUST00000223365 642 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Lrrc3b-203ENSMUST00000223700 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 CT009733.1-203ENSMUST00000224033 451 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 2810006K23Rik-201ENSMUST00000077376 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm7416-201ENSMUST00000117448 1487 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm28971-201ENSMUST00000187506 1498 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm28152-201ENSMUST00000188694 1498 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Lrrc43Q3V0L5 Gm19065-202ENSMUST00000203910 1165 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 4930402F11Rik-201ENSMUST00000207348 1000 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Cyp3a61-ps1-201ENSMUST00000218470 592 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Tbca-204ENSMUST00000220825 497 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Rida-201ENSMUST00000022946 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Lrrc43Q3V0L5 Zfp934-201ENSMUST00000082203 993 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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