Protein–RNA interactions for Protein: Q3USZ8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3USZ8 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3USZ8 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3USZ8 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3USZ8 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3USZ8 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3USZ8 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3USZ8 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3USZ8 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3USZ8 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3USZ8 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3USZ8 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
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Q3USZ8 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Q3USZ8 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3USZ8 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3USZ8 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3USZ8 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3USZ8 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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